遠隔地（例九州）からFAXのデータを、本社（例東京）にあるSynoloyに飛ばして保存することは可能ですか？

Synologyの機能でFAXからデータを受け取るものはありません。
VPN環境があり、同一ネットワーク内にSynologyとFAX機がありCIFS経由でデータを保存する機能がFAXにあれば実現可能です。またSynologyが二台あるのであればVPNが無くてもSynology Drive ShareSyncを利用することによって同期は可能です。