Cloud Syncの双方向同期に関しまして、Synologyと紐づけられるクラウドストレージのアカウントは１つのみでしょうか?

複数アカウント紐づけが可能ですが、同じ共有フォルダを同期するのは更新のタイミングがそれぞれ異なるので、推奨しておりません。別々のフォルダを別々のアカウントと紐付ける場合であれば、問題ありません。
また、アカウント数に上限はございません。ただし、アカウントが増加するとNASの性能や使用状況、ネットワークの帯域やファイルの変更頻度、パブリッククラウド側の同期制限などから同期のパフォーマンスに遅延が発生することがありますのでご留意ください。