メイン機からバックアップ設定をしている状態でバックアップ機のDS120jの管理パスワードを変更しても問題はないでしょうか？

HyperBackupのタスク設定のターゲットより、管理パスワード変更後、新しい管理者ユーザアカウントでログインし認証をしなおす必要があります。