サーバに入れているOracle等のソフトもSynologyにバックアップできますでしょうか？

Oracleの機能を利用して、Synologyにバックアップをエクスポート想定であれば問題ございません。
OracleのデータベースをSynologyに保管することは出来ませんのでご注意いただければと思います。