Cloud Syncを利用しているのですが、ファイ名に「Conflict.xlsx」などが付加されているものがいくつかあるのですが、この発生条件はどのような条件になるのでしょうか？

Cloud Syncでスケジュール同期などをしている場合に起こり得ます。初めの同期でファイルが複製されたあと、同じ名前のファイルを再同期するタイミングで、片方のデータが更新されており、データの整合性が取れずコンフリクトファイルが作成された　という現象かと思います。