フォルダ・ファイル単位での復元の場合は、「ActiveBackup for Business Portal」から可能です。
https://www.synology.com/ja-jp/knowledgebase/DSM/help/ActiveBackup/activebackupforbusinessportal
ベアメタル復旧が必要な場合は、事前にリカバリメディアを作成頂く必要ございます。
https://www.synology.com/ja-jp/knowledgebase/DSM/help/ActiveBackup/activebackup_recovery_media_creator